Özet

Amaç: İdrar yolu infeksiyonları toplum kaynaklı olarak en sık karşılaşılan bakteriyel infeksiyonlardan olup her yaş grubunda görülebilir. Çalışmamızda, idrar yolu infeksiyonlarında Escherichia coli ve Klebsiella spp.’ın yıllara göre dağılımını ve toplum kökenli idrar yolu infeksiyonlarında ilk seçenek olarak kullanılan trimetoprim-sülfametaksazol (TMP-SXT) ve siprofloksasin antibiyotiklerinin direnç oranlarının incelenmesini amaçladık.

Yöntemler: Çalışmada, Ocak 2011 ile Ağustos 2021 tarihleri arasında poliklinikler ve acil servislerden Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen her yaş grubuna ait tüm idrar kültür örnekleri incelendi. Üreyen bakterilerin tanımlanmasında ve antibiyotik duyarlılık testlerinde konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemlerle çalışıldı. Çalışmaya idrar kültüründe etken olarak E. coli ve Klebsiella spp. saptanan örnekler ve siprofloksasin ve TMP-SXT için antibiyogram sonuçları dahil edildi.

Bulgular: Çalışma kapsamında E. coli (n=50 430) ve Klebsiella spp. (n=7763) üreyen idrar kültürleri analiz edildi. E. coli için siprofloksasin ve TMP-SXT direnç oranları sırasıyla en düşük ve en yüksek olarak %25-40 ve %35-51 idi. Klebsiella spp. için siprofloksasin ve TMP-SXT direnç oranları ise sırasıyla en düşük ve en yüksek olarak %17-43 ve %31-43 saptandı.

Sonuç: Toplum kökenli idrar yolu infeksiyonlarının tedavisinde E. coli ve Klebsiella spp. gibi sık görülen etkenlere karşı ilk seçenek olarak kullanılan antibiyotiklerin direnç oranlarının bilinmesi ampirik antimikrobiyal tedavide yol gösterici olabilir.

GİRİŞ

İdrar yolu infeksiyonları (İYE), tüm dünyada en sık karşılaşılan infeksiyonların başında gelmektedir. Ülkemizde her yıl ortalama 5 milyon olgunun İYE tanısı aldığı bildirilmektedir (1). Tüm yaş gruplarında ve her iki cinste toplum kökenli İYE’ye sıklıkla Escherichia coli ve Klebsiella spp. gibi Gram-negatif basiller neden olmaktadır (2).

İdrar yolu infeksiyonları piyüri ve çeşitli klinik semptomların eşlik ettiği böbrek, toplayıcı sistem ve mesane inflamasyonu olarak tanımlanır. Klinik bulgular; hastanın yaşı, cinsiyeti ve eşlik eden hastalıklar nedeniyle değişkenlik gösterebilir. Bulgular sepsisle sonuçlanabilen akut piyelonefritten, asemptomatik bakteriüriye kadar çok çeşitli yelpazede olabilir (3). Antibiyogram test sonucunun zaman alması nedeniyle genellikle hastalara ampirik antibiyotik tedavisi uygulanmaktadır. Gelişmiş ülkelerde İYE tedavisinde kullanılan antibiyotikler toplamda kullanılan antibiyotiklerin yaklaşık %15’ini oluşturmakta olup trimetoprim-sülfametoksazol (TMP-SXT) ve siprofloksasin İYE tedavisinde en sık kullanılan ajanlar arasında yer almaktadır (3).

Toplum kökenli İYE’lerde ampirik tedaviye yanıt alınamaması durumunda ya da tekrarlayan olgularda idrar kültürü ve antibiyotik duyarlılık sonuçlarına başvurulmaktadır. Tedavide ideal antibiyotiğin belirlenebilmesi için yerel antibiyotik direnç durumunun düzenli olarak takip edilmesi önemlidir (4). Artan antimikrobiyal direnç, ampirik antibiyotik seçiminde önemli bir sorun oluşturmakta ve tedavi başarı oranlarını düşürmektedir (5). Çalışmamızda, toplum kökenli İYE şüphesiyle hastanemiz laboratuvarına gelen idrar örneklerinde etken olarak E. coli ve Klebsiella spp.’ın yıllara göre dağılımını ve TMP-SMT ve siprofloksasin antimikrobiyal direnç oranlarını incelemeyi amaçladık.

YÖNTEMLER

Çalışma kapsamında, Ocak 2011 ile Ağustos 2021 tarihleri arasında poliklinikler ve acil servislerden Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen her yaş grubuna ait tüm idrar kültür örnekleri retrospektif olarak incelendi. İdrar örneğinde 104 cfu/ml ve üzerinde koloni oluşturarak üreyen bir çeşit mikroorganizma idrar yolu infeksiyonunun etkeni olarak kabul edildi (6). Çalışmaya, idrar kültüründe etken olarak E. coli ve Klebsiella spp. saptanan örnekler ve bunların TMP-SXT, siprofloksasin duyarlılık sonuçları dahil edildi. Kontaminasyon olarak sonuçlanan veya mikolojik üremesi olan kültür örnekleri çalışma dışı bırakıldı. Her hastanın tek bir örneği çalışmaya dahil edildi. Kültür sonuçları, üreyen etken ve antibiyotik duyarlılıkları açısından değerlendirildi.

Örnekler, standart 0.01 ml’lik öze ile %5 koyun kanlı agar ve “eosin methylen blue” (EMB) agara kantitatif yöntemle ekildi. Aerop koşullarda 35-37 ⁰C’lik etüvde, 24-48 saat inkübe edildikten sonra üreme kontrolü yapıldı. Üreyen bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel yöntemler (Kirby Bauer disk difüzyon yöntemi) ve otomatize sistemlerle (Phoenix BD ve Bruker MALDI-TOF MS) çalışıldı. Antibiyogram verileri; 2011-2015 yılları arasında Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (Clinical and Laboratory Standards Institute – CLSI) ve 2016-2021 yılları arasında Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Komitesi (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing – EUCAST) önerileri doğrultusunda değerlendirildi (7).

Verilerin analizi, SPSS (Statistical Package for the Social Sciences) versiyon 22.0 programı (IBM Corp., Armonk, NY, ABD) ile yapıldı. Kalitatif veriler gözlem sayısı ve sıklığı (%), kantitatif veriler ortanca, çeyrekler arası aralık, minimum (min), maksimum (mak) değerler ile ifade edildi. Kantitatif verilerin analizinde Mann-Whitney U testi ve kalitatif verilerin analizinde χ2 testi kullanıldı. Tüm analizler %95 güven aralığı (GA)’nda yapıldı ve p<0.05 değerleri istatistiksel olarak anlamlı düzey olarak kabul edildi.

Çalışma, Sağlık Bilimleri Üniversitesi İzmir Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Girişimsel Olmayan Araştırmalar Etik Kurulu tarafından 11 Ocak 2023 tarih ve 2022\12-29 karar numarasıyla onaylandı.

BULGULAR

Şekil 1. Escherichia coli İçin Yıllara Göre Siprofloksasin Direnç Oranları

Şekil 2. Escherichia coli İçin Yıllara Göre Trimetoprim-Sülfametoksazol (TMP-SMX) Direnç Oranları

Şekil 3. Klebsiella spp. İçin Yıllara Göre Siprofloksasin Direnç Oranları

Şekil 4. Klebsiella spp. İçin Yıllara Göre Trimetoprim-Sülfametoksazol (TMP-SMX) Direnç Oranları

Şekil 5. Cinsiyet İçin Yıllara Göre Siprofloksasin Direnç Oranları

Şekil 6. Cinsiyet İçin Yıllara Göre Trimetoprim-Sülfametoksazol (TMP-SMX) Direnç Oranları

Çalışmamız kapsamında, Ocak 2011 – Ağustos 2021 tarihleri arasında E. coli (n=50 430) ve Klebsiella spp. (n=7763) üreyen idrar kültürleri analiz edildi. Hastaların %74.3’ü kadın olup medyan yaş 30 [“interquartile range” (IQR)=52; min-maks=0-100] yıl idi.

Siprofloksasin ve TMP-SXT direnç oranları E. coli için sırasıyla en düşük ve en yüksek %25-40 ve %35-51 aralığında saptandı (Şekil 1 ve 2).  Klebsiella spp. için ise direnç oranları sırasıyla en düşük ve en yüksek %17-43 ve %31-43 aralığındaydı (Şekil 3 ve 4).

Erkek cinsiyette siprofloksasin ve TMP-SXT direnç oranları kadın cinsiyete göre anlamlı düzeyde daha yüksek saptandı (p<0.001) (Şekil 5 ve 6).

İRDELEME

İdrar yolu infeksiyonları toplum kaynaklı olarak en sık karşılaşılan bakteriyel infeksiyonlardan olup her yaş grubunda görülebilir. Asemptomatik bakteriüri ve sistit gibi hafif klinik tablolardan piyelonefrit ve ürosepsise kadar değişebilen geniş klinik yelpazesi bulunan bu infeksiyonlar önemli morbidite ve mortalite nedenidir (8). Yüksek nüks oranları ve izole edilen bakterilerdeki artan antibiyotik direnci nedeniyle söz konusu infeksiyonların önemi artmaktadır (8). Toplum kökenli İYE’ye en sık neden olan mikroorganizmalar, Gram-negatif basiller olup bunlar arasında ilk sırayı E. coli (%50-90) almaktadır (2); E. coli’den sonra en sık izole edilen patojenler arasında Klebsiella spp. bulunmaktadır (9).

İdrar yolu infeksiyonu tanısında altın standart yöntem kültürdür. Kültür ve antibiyogram işlemlerinin sonuçlanması zaman aldığından, hekimler sıklıkla ampirik tedaviye başlamayı tercih etmektedir. Ampirik tedavide kullanılacak ajanların doğru seçimi için bölgenin etken dağılımı ve antibiyotik direnç durumunun bilinmesi önemlidir (10). Avrupa Üroloji Derneği (European Association of Urology – EAU) rehberlerinde belli oranların üzerinde direnç saptanan antibiyotiklerin, ampirik tedavide kullanımları önerilmektedir (11). Ülkemiz genelinde yerel sürveyans verilerinin, sık karşılaşılan etkenlerin ve direnç oranlarının belirli aralıklarla güncellenmesi, özellikle ampirik antimikrobiyal ajan seçiminde yol gösterici olacaktır. Çalışmamızda, toplum kökenli İYE’lerde en sık karşılaşılan etkenler olan E. coli ve Klebsiella spp.’de son 10 yıl içerisindeki siprofloksasin ve TMP-SXT direnç oranlarını değerlendirdik.

İdrar yolu infeksiyonlarının tedavisinde antibiyotiklere sıklıkla ampirik olarak başlanmaktadır. En sık kullanılan ajanlar TMP-SXT ve siprofloksasindir (1). Bu antibiyotiklerin sık kullanımının nedeni olarak direnç oranlarının yüksek olması gösterilmektedir. Güney Kore’de yapılan bir çalışmada, E. coli için siprofloksasin direncinin %23.4 olduğu tespit edilmiştir (12). Ülkemizde yapılan çalışmalarda ise E. coli için siprofloksasin direnç oranı %38-55 arasında bildirilmiştir (3,13,14). Duran ve arkadaşlarının (5) çalışmasında, TMP-SXT’nin direnç oranının %42.6 olduğu tespit edilmiştir. Çalışmamızda, 10 yıllık dönemde E. coli için siprofloksasin direnç oranlarının %25-40, TMP-SXT direnç oranlarının ise %35-51 arasında olduğunu tespit ettik. E. coli için siprofloksasin direnç oranlarının yıllar içerisinde (2011-2017 yılları arasında) önce azalma, sonrasında (2018-2021 yılları arasında) ise tekrar yavaş bir şekilde artma eğiliminde olduğunu saptadık. E. coli için TMP-SXT direnç oranlarının ise yıllar içerisinde azalma eğiliminde olduğunu saptadık. Siprofloksasin direnç oranlarının yıllar içerisinde önce azalma, sonra artma eğiliminde olması, hekimler arasında bu ajana karşı direnç oranlarının fazla olduğu kanısı nedeni ile reçete edilmesindeki çekinceler ile açıklanabilir.

Birçok çalışma, İYE’lerde Klebsiella spp.’nin E. coli’den sonra ikinci sıklıkta izole edildiğini ve genel olarak antibiyotik direnç oranlarının E. coli’ye göre daha yüksek olduğunu göstermektedir (15). Ülkemizde yapılan çalışmalarda, Klebsiella spp. izolatlarında direnç oranları değişkenlik göstermekle birlikte TMP-SXT için %34-46 ve siprofloksasin için %23-40 olarak bildirilmiştir (2,10). Çalışmamızda son 10 yıl içerisinde Klebsiella spp. için siprofloksasin direnç oranlarının %17-43, TMP-SXT direnç oranlarının ise %31-43 arasında olduğunu tespit ettik. Klebsiella spp. için siprofloksasin direnç oranlarının da yıllar içerisinde (2011-2014 yılları arasında) önce azalma, sonrasında (2015-2021 yılları arasında) ise artma eğiliminde olduğunu; TMP-SXT direnç oranlarının ise yıllar içerisinde yavaş bir artış eğiliminde olduğunu saptadık.

Çalışmamızda, 10 yıllık dönemde hem TMP-SXT hem de siprofloksasine karşı direnç oranlarının her iki cinsiyette de azalma eğiliminde olduğunu saptadık. Bununla birlikte, her iki ajana karşı direnç oranlarının erkeklerde kadınlara göre daha fazla olduğunu tespit ettik.

Retrospektif ve tek merkezli olması, kültürde etken olarak saptanan tüm mikroorganizmaların çalışmaya dahil edilememesi, dahil edilen etken mikroorganizmalarda sadece iki ajana ait direnç oranlarının analiz edilmesi, hastaların klinik bulguları ve sonlanımları ile ilgili herhangi bir analiz yapılmaması çalışmamızın kısıtlıklarıydı. Örneklerin poliklinikten ve acil servisten gelen hasta örnekleri olması nedeniyle üreyen bakterilerin sağlık bakımı ile ilişkili infeksiyon etkenleri olup olmadığı ayırt edilemedi. Bu da çalışmamızın bir diğer kısıtlılığı olarak değerlendirildi.

Toplum kökenli idrar yolu infeksiyonlarında, sık görülen E. coli ve Klebsiella spp. için siprofloksasin direnç oranları yıllar içerisinde önce azalma, sonrasında ise tekrar yavaş bir şekilde artma eğilimindedir. E. coli için TMP-SXT direnç oranları yıllar içerisinde azalma eğiliminde iken, Klebsiella spp. için ise yıllar içerisinde yavaş bir artış eğilimindedir. Sonuç olarak; sık görülen etkenlere karşı direnç oranlarının bilinmesi ampirik antimikrobiyal tedaviye başlanması gerekli olan durumlarda hekimlere yol gösterici olabilir.

Hasta Onamı
Laboratuvar bulguları retrospektif olarak incelendiği için hasta onamı alınmamıştır.

Etik Kurul Kararı
Çalışma, Sağlık Bilimleri Üniversitesi İzmir Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Girişimsel Olmayan Araştırmalar Etik Kurulu tarafından 11 Ocak 2023 tarih ve 2022\12-29 karar numarasıyla onaylanmıştır.

Danışman Değerlendirmesi
Bağımsız dış danışman

Yazar Katkıları
Fikir/Kavram – P.Ş.; Tasarım – P.Ş., İ.K.; Denetleme – P.Ş., İ.K.; Veri Toplama ve/veya İşleme – P.Ş., İ.K.; Analiz ve/veya Yorum – P.Ş., İ.K.; Literatür Taraması – P.Ş., İ.K.; Makale Yazımı – P.Ş.; Eleştirel İnceleme – İ.K.

Çıkar Çatışması
Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması bildirmemiştir.

Finansal Destek
Yazarlar finansal destek beyan etmemiştir.

 

Referansları Görüntüle

Referanslar

  1. Yüksek G, Memiş N, Öksüz Ş. [Antibiotic susceptibility Of Escherichia coli strains isolated from urine samples]. DÜ Sağlık Bil Enst Derg. 2021;11(2):137-42. Turkish. [CrossRef]
  2. Karamanlıoğlu D, Aysert Yıldız P, Kaya M, Sarı N. [Extended-spectrum β-lactamase production rates and antibiotic susceptibilities among Enterobacteriaceae isolated from urine cultures]. Klimik Derg. 2019;32(3):233-9. Turkish.  [CrossRef]
  3. Çilburunoğlu M, Kirişci Ö, Yerlikaya H, Uğurlu H, Aral M, Muratdağı G. [The evaluation of the distribution and antimicrobial susceptibility profile of strains isolated from urine specimens at a university hospital]. Sakarya Tıp Derg. 2020;10(4):677-83. Turkish. [CrossRef]
  4. Akata F. Üriner sistem infeksiyonlarında uygun antibiyotik kullanımı. Klimik Derg. 2001;14(3):114-23.
  5. Duran H, Çeken N, Kula-Atik T. [Antibiotic resistance rates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains isolated from urine culture: A four-year analysis]. ANKEM Derg. 2020;34(2):41-7. Turkish. [CrossRef]
  6. Klinik örnekten sonuç raporuna uygulama rehberi: Üriner sistem örnekleri, 2015 [Internet]. Ankara: Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlığı Derneği (KLİMUD). [erişim 25 Ocak 2021]. https://www.klimud.org/public/uploads/files/uriner-sistem-ornekleri.pdf
  7. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 9.0. [Internet]. Växjö: European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). [erişim 24 Nisan 2020]. https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Breakpoint_tables/v_9.0_Breakpoint_Tables.pdf
  8. Tekin A, Deveci Ö, Dal T, Tekin R, Özekinci T, Dayan S. [In vitro effectiveness of fosfomycin and some antibiotics for uropathogenic Escherichia coli isolates]. Ankem Derg. 2012;26(2):61-8. Turkish. [CrossRef]
  9. Ağca H. [Bacteria isolated from urine samples and their antimicrobial susceptibilities]. KTD. 2011;12(2):95-100. Turkish.
  10. Keskin BH, Çalışkan E, Kaya S, Köse E, Şahin İ. [Bacteria that cause urinary system infections and antibiotic resistance rates]. Turk Mikrobiyol Cem Derg. 2021;51(3):254-62. Turkish. [CrossRef]
  11. Guidelines on Urological infections, 2020 [Internet]. Arnhem: European Association of Urology (EAU). [erişim 25 Ocak 2021]. https://uroweb.org/guidelines/urological-infections/chapter/the-guideline
  12. Kim ME, Ha US, Cho YH. Prevalence of antimicrobial resistance among uropathogens causing acute uncomplicated cystitis in female outpatients in South Korea: a multicentre study in 2006. Int J Antimicrob Agents. 2008;31 Suppl 1:S15-8. [CrossRef]
  13. Saraçoğlu KT, Fidan V, Pekel Ö, Saraçoğlu A, Kalkandelen S, Arpalı E. [The antibiotic sensitivity of bacteria isolated from urine cultures]. J Clin Exp Invest. 2013;4(3):356-9. Turkish. [CrossRef]
  14. Şen P, İrer B, Demirdal T, Yaygın YE. [Evaluation of risk factors associated with fluoroquinolone-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae urinary tract infections]. Ege Tıp Dergisi. 2019;58(3):215-21. Turkish. [CrossRef]
  15. Temiz H, Özbek E, Vural DG, Özekinci T. [Evaluation of antimicrobial resistance rates of Klebsiella isolates]. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2015;45(2):68-74. Turkish. [CrossRef]
Cilt 37, Sayı 1 Cilt 36, Sayı 4 Cilt 36, Özel Sayı 1 Cilt 36, Sayı 3 Cilt 36, Sayı 2 Cilt 36, Sayı 1 Cilt 35, Sayı 4 Cilt 35, Sayı 3 Cilt 35, Sayı 2 Cilt 35, Sayı 1 Cilt 34, Sayı 3 Cilt 34, Sayı 2 Cilt 34, Sayı 1 Cilt 33, Sayı 3 Cilt 33, Sayı 2 Cilt 33, Sayı 1 Cilt 32, Sayı 3 Cilt 32, Özel Sayı 2 Cilt 32, Özel Sayı 1 Cilt 32, Sayı 2 Cilt 32, Sayı 1 Cilt 31, Sayı 3 Cilt 31, Sayı 2 Cilt 31, Özel Sayı 1 Cilt 31, Sayı 1 Cilt 30, Sayı 3 Cilt 30, Sayı 2 Cilt 30, Özel Sayı 1 Cilt 30, Sayı 1 Cilt 29, Sayı 3 Cilt 29, Sayı 2 Cilt 29, Sayı 1 Cilt 28, Özel Sayı 1 Cilt 28, Sayı 3 Cilt 28, Sayı 2 Cilt 28, Sayı 1 Cilt 27, Özel Sayı 1 Cilt 27, Sayı 3 Cilt 27, Sayı 2 Cilt 27, Sayı 1 Cilt 26, Sayı 3 Cilt 26, Özel Sayı 1 Cilt 26, Sayı 2 Cilt 26, Sayı 1 Cilt 25, Sayı 3 Cilt 25, Sayı 2 Cilt 25, Sayı 1 Cilt 24, Sayı 3 Cilt 24, Sayı 2 Cilt 24, Sayı 1 Cilt 23, Sayı 3 Cilt 23, Sayı 2 Cilt 23, Sayı 1 Cilt 22, Sayı 3 Cilt 22, Sayı 2 Cilt 21, Sayı 3 Cilt 22, Sayı 1 Cilt 21, Özel Sayı 2 Cilt 21, Sayı 2 Cilt 21, Özel Sayı 1 Cilt 21, Sayı 1 Cilt 20, Özel Sayı 2 Cilt 20, Sayı 3 Cilt 20, Sayı 2 Cilt 20, Sayı 1 Cilt 20, Özel Sayı 1 Cilt 19, Sayı 3 Cilt 19, Sayı 2 Cilt 19, Sayı 1 Cilt 18, Özel Sayı 1 Cilt 18, Sayı 3 Cilt 18, Sayı 2 Cilt 18, Sayı 1 Cilt 17, Sayı 3 Cilt 17, Sayı 2 Cilt 17, Sayı 1 Cilt 16, Sayı 3 Cilt 16, Sayı 2 Cilt 16, Sayı 1 Cilt 1, Özel Sayı 1 Cilt 15, Sayı 2 Cilt 15, Sayı 3 Cilt 15, Sayı 1 Cilt 14, Sayı 3 Cilt 14, Sayı 2 Cilt 14, Sayı 1 Cilt 13, Sayı 3 Cilt 13, Sayı 2 Cilt 13, Özel Sayı 1 Cilt 13, Sayı 1 Cilt 12, Sayı 3 Cilt 12, Sayı 2 Cilt 12, Sayı 1 Cilt 11, Sayı 3 Cilt 11, Sayı 2 Cilt 11, Özel Sayı 1 Cilt 11, Sayı 1 Cilt 10, Sayı 3 Cilt 10, Sayı 2 Cilt 10, Sayı 1 Cilt 9, Sayı 3 Cilt 9, Sayı 2 Cilt 9, Sayı 1 Cilt 8, Sayı 3 Cilt 8, Sayı 2 Cilt 6, Sayı 3 Cilt 7, Sayı 1 Cilt 7, Sayı 2 Cilt 7, Sayı 3 Cilt 8, Sayı 1 Cilt 5, Sayı 1 Cilt 5, Sayı 2 Cilt 5, Sayı 3 Cilt 6, Sayı 1 Cilt 6, Sayı 2 Cilt 3, Sayı 1 Cilt 3, Sayı 2 Cilt 3, Sayı 3 Cilt 4, Sayı 1 Cilt 4, Sayı 2 Cilt 4, Sayı 3 Cilt 2, Sayı 1 Cilt 2, Sayı 2 Cilt 2, Sayı 3 Cilt 1, Sayı 1 Cilt 1, Sayı 2