Ama\u00e7<\/strong>: Karbapenemazlar\u0131 kodlayan genlerin saptanmas\u0131nda molek\u00fcler testlerin h\u0131zl\u0131, g\u00fcvenilir ve \u00e7e\u015fitli se\u00e7eneklerinin bulunmas\u0131na kar\u015f\u0131n, maliyet, iyi e\u011fitimli teknisyen ihtiyac\u0131 ve cihaz gereksinimleri bu testlerin yayg\u0131n kullan\u0131m\u0131n\u0131 k\u0131s\u0131tlamaktad\u0131r. Bu sorunlar\u0131 a\u015fabilmek i\u00e7in son y\u0131llarda geli\u015ftirilmi\u015f olan izotermal amplifikasyon y\u00f6ntemlerinden biri olan rekombinaz polimeraz amplifikasyon (RPA) y\u00f6ntemi hedefin denat\u00fcrasyonunu gerektirmez ve prob tabanl\u0131 saptama y\u00f6ntemleriyle RPA \u00fcr\u00fcnleri \u00f6zel bir cihaz olmadan bile saptanabilir. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada RPA tabanl\u0131 izotermal amplifikasyon y\u00f6ntemiyle yanal ak\u0131m sistemi birle\u015ftirilerek blaOXA-48\u2019i saptayacak h\u0131zl\u0131 ve sahada kolay uygulanabilir bir molek\u00fcler test format\u0131n\u0131n geli\u015ftirilmesi ama\u00e7lanm\u0131\u015ft\u0131r.<\/p>\n Y\u00f6ntemler<\/strong>: Bu \u00e7al\u0131\u015fmada hastanemiz hastane infeksiyon kontrol komitesine ait karbapeneme diren\u00e7li ve duyarl\u0131 koleksiyon k\u00f6kenleri (24 OXA-48-pozitif k\u00f6ken, birer VIM-, IMP-, NDM, KPC-pozitif k\u00f6ken ve 10 karbapeneme duyarl\u0131 OXA-48-negatif k\u00f6ken) \u00e7al\u0131\u015fmaya dahil edildi. K\u00f6kenlerin Mueller-Hinton agar\u0131nda 24 saatlik k\u00fclt\u00fcrleri haz\u0131rland\u0131ktan sonra 1\u00d7 polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tamponunda yo\u011funluklar\u0131 0.5 McFarland standard\u0131nda olacak \u015fekilde s\u00fcspansiyonlar\u0131 haz\u0131rland\u0131. Testin performans\u0131n\u0131n ve alt saptama s\u0131n\u0131r\u0131n\u0131n belirlenmesi i\u00e7in OXA-48-pozitif k\u00f6kenden de dil\u00fcsyonlar haz\u0131rland\u0131. Bu \u00f6rneklerden kaynatma y\u00f6ntemiyle n\u00fckleik asid izolasyonu yap\u0131ld\u0131. \u00d6rnekler, tasarlanan blaOXA-48 RPA primerleri ve NFO probuyla, RPA y\u00f6ntemi kullan\u0131larak \u00fcretici (TwistAmp\u00ae nfo kit, TwistDx, Cambridge, Birle\u015fik Krall\u0131k) talimatlar\u0131 do\u011frultusunda amplifiye edildi. RPA \u00fcr\u00fcnlerinin saptanmas\u0131 i\u00e7in yanal ak\u0131m y\u00f6ntemi kullan\u0131ld\u0131.<\/p>\n Bulgular<\/strong>: OXA-48 enzimini kodlayan b\u00fct\u00fcn k\u00f6kenler yakla\u015f\u0131k 45 dakikada hi\u00e7bir \u00f6zel cihaza gerek duymadan saptand\u0131. Saptama alt limiti 10 bakteri olarak belirlendi. Karbapenem direncine neden olan di\u011fer enzimleri kodlayan k\u00f6kenlerde ya da OXA-48 kodlamayan k\u00f6kenlerde pozitif sinyal saptanmad\u0131.<\/p>\n Sonu\u00e7lar<\/strong>: Yeni geli\u015ftirilen bu test format\u0131, uygulanmas\u0131n\u0131n basit olmas\u0131 ve \u00f6zel bir\u00a0 cihaz gerektirmemesi dolay\u0131s\u0131yla, bu t\u00fcr enzimlerin taranmas\u0131 i\u00e7in gerek laboratuvar gerek saha ko\u015fullar\u0131nda, di\u011fer molek\u00fcler testlere (PCR, \u201creal-time\u201d PCR gibi) bir alternatif y\u00f6ntem olu\u015fturabilir. Klimik Dergisi 2018; 31(3): 185-9.<\/p>\n Cite this article as<\/strong>: Ku\u015fkucu MA, Ayg\u00fcn G, Karakulluk\u00e7u A, \u0130mamova N, K\u00fc\u00e7\u00fckbasmac\u0131 \u00d6, Midilli K. [Development of a rapid molecular test format based on isothermal recombinase polymerase amplification technique and lateral flow method for detection of blaOXA-48]. Klimik Derg. 2018; 31(3): 185-9. Turkish.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" \u00d6zet Ama\u00e7: Karbapenemazlar\u0131 kodlayan genlerin saptanmas\u0131nda molek\u00fcler testlerin h\u0131zl\u0131, g\u00fcvenilir ve \u00e7e\u015fitli se\u00e7eneklerinin bulunmas\u0131na kar\u015f\u0131n, maliyet, iyi e\u011fitimli teknisyen ihtiyac\u0131 ve cihaz gereksinimleri bu testlerin yayg\u0131n kullan\u0131m\u0131n\u0131 k\u0131s\u0131tlamaktad\u0131r. Bu sorunlar\u0131 a\u015fabilmek i\u00e7in son y\u0131llarda geli\u015ftirilmi\u015f olan izotermal amplifikasyon y\u00f6ntemlerinden biri olan rekombinaz polimeraz amplifikasyon (RPA) y\u00f6ntemi hedefin denat\u00fcrasyonunu gerektirmez ve prob tabanl\u0131 saptama y\u00f6ntemleriyle RPA […]<\/p>\n","protected":false},"author":0,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[5129],"tags":[4815,4816,4818],"class_list":["post-14561","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-ozgun-arastirma","tag-blaoxa48","tag-izotermal-amplifikasyon-rekombinaz-polimeraz-amplifikasyon-teknigi","tag-yanal-akim-yontemi"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14561","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14561"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14561\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14561"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14561"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.klimikdergisi.org\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14561"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}